OPIS PREDMETA
Biogeografija in filogeografija
Program:
Okoljske in regionalne študije (3. stopnja)
Modul:Biodiverziteta in ekologija (3. stopnja)
Koda predmeta: DIB09-26
Letnik: Brez letnika
Nosilec
Red. prof. dr. Matjaž Kuntner
ECTS: 6
Obseg: predavanja 5 ur, seminar 15 ur, vaje 10 ur, samostojno delo 150 ur
Vrsta predmeta: izbirni
Jeziki: slovenski, angleški
Pogoji za vključitev v delo oz. za opravljanje študijskih obveznosti:
Končana druga bolonjska stopnja ustrezne smeri ali univerzitetni študij VII stopnje. Zaželeno je razumevanje biologije, ekologije ali sorodnih naravoslovnih ved.
Vsebina:
- Geografski vzorci razširjenosti organizmov.
- Vikarianca kot zgodovinski vzrok razširjenosti.
- Disperzija in disperzivnost kot lastnost organizmov.
- Globalne spremembe in posledično spreminjanje razširjenosti organizmov.
- Otoška biogeografija.
- Genski pretok, speciacija, izumiranje.
- Endemizem.
- Filogeografija kot interakcija mikro- in makro-evolucijskih raziskav.
- Pregled modernih biogeografskih in filogeografskih pristopov.
- Seminarsko delo v obliki znanstvenega članka.
Temeljni literatura in viri:
- Lomolino, M. V., Riddle, B. R., Whittaker, R. J., Brown, J. H. (2010). Biogeography. Fourth Edition. Sinauer Associates, Inc.
- Avise, J. C. (2000). Phylogeography: The History and Formation of Species. Harvard University Press.
- Izbrana primarna literatura.
Cilji in kompetence:
Namen predmeta je seznaniti študente z biogeografskimi koncepti. V prvem delu bodo študenti skozi predavanja spoznavali osnove moderne biogeografije, ki je v šestdesetih letih prejšnjega stoletja prešla iz opisne v preverljivo znanost. Spoznali bodo vzorce razširjenosti organizmov, od najpreprostejše dihotomije ‘vikarianca proti disperziji’ do kompleksnih mešanic obojega. Spoznali bodo tudi vzroke za raznolike vzorce razširjenosti organizmov, ki so direktno povezani z disperzijsko zmožnostjo organizmov ter v novi dobi tudi z globalnimi spremembami. Z biogeografskimi vzorci so povezani tudi genski pretok, endemizem, speciacija in izumiranje. Študenti bodo spoznali osnove biogeografije otokov in razvoj filogeografije, moderne znanosti, ki povezuje mikro- in makro-evolucijske raziskave biogeografskih vzorcev. V praktičnem delu bodo študenti postavili biogeografska in/ali filogeografska vprašanja o izbranih skupinah organizmov, iz literature pridobivali genetske in geografske podatke ter jih analizirali v modernem filogenetskem kontekstu. Seminarski del predmeta bo potekal skozi študij primarne literature in pisanje znanstvenega članka, v katerem bo študent testiral konkretno hipotezo s pomočjo analiziranih podatkov.
Predvideni študijski rezultati:
- Poznavanje metod in konceptov v biogeografiji.
- Pridobivanje podatkov potrebnih za moderne biogeografske in filogeografske analize.
- Uporaba modernih analitičnih metod za reševanje konkretnih biogeografskih hipotez ter seminar v obliki znanstvenega članka.
Metode poučevanja in učenja:
Oblike dela:
- Frontalna oblika poučevanja
- Delo v manjših skupinah oz. v dvojicah
- Samostojno delo študentov
Metode (načini) dela:
- Razlaga
- Razgovor/ diskusija/debata
Načini ocenjevanja:
- Daljši pisni izdelki 100 %
Reference nosilca:
- Kuntner, M. & Turk, E. 2022. Towards better-informed dispersal probabilities in historical biogeography: Arachnids as a model lineage. Frontiers in Arachnid Science 1: 1058676.
- Čandek, K., Agnarsson, I., Binford, G. J. & Kuntner, M. 2021. Biogeography of long-jawed spiders reveals multiple colonization of the Caribbean. Diversity 13: 622.
- Turk E., Čandek, K., Kralj-Fišer, S., Kuntner M. 2020. Biogeographical history of golden orbweavers : chronology of a global conquest. Journal of biogeography 47: 1333-1344.
- Turk, E., Bond, J.E., Cheng, R.-C., Čandek, K., Hamilton, C.A., Gregorič, M., Kralj-Fišer, S. & Kuntner, M. 2021. A natural colonisation of Asia: phylogenomic and biogeographic history of coin spiders (Araneae: Nephilidae: Herennia). Diversity 13, 515. https://doi.org/10.3390/d13110515
- Xu, X., Su, Y.-S., Ho, S. Y. W., Kuntner, M., Ono, H., Liu, F., Chang, C.-C., Warrit, N., Sivayyapram, V., Aung, K. P. P., Pham, D. S., Norma-Rashid, Y., Li, D. 2021. Phylogenomic analysis of ultraconserved elements resolves the evolutionary and biogeographic history of segmented trapdoor spiders. Systematic Biology 70: 1110-1122.


